Im 3. OG soll der Burghausen prägende Naturraum mit dem Landschaftsschutzgebiet „Salzachtal“ anhand von Exponaten, großformatigen Bildern und Inszenierungen erläutert und an Forscherstationen erlebbar gemacht werden. Die Dauerausstellung gliedert sich in folgende Themen:
- Salzach
- Salzachdurchbrüche: Engstellen mit Steilufern in der Nonnreiter Enge und im Fakten mit Quelle, Länge, Mündung, Charakteristika
- Geologie und Entstehung in der letzten Eiszeit
- Flussgeschichte mit Wasserbau, Salzachkorrektion und Renaturierung heute
- Landschaftsschutzgebiet Salzachtal
- Lebensraum Fluss: Fließendes Wasser und Kiesbänke mit Flora und Fauna
- An den Fluss angrenzende Auen-, Hang- und Leitenwälder mit versinterten Quellaustritten und der dort lebenden Tierwelt
- Salzachdurchbruch in Burghausen mit Kreuzfelsen mit der besonderen Thematik des Waldrapp-Wiederansiedlungsprojektes
- Wöhrseebecken mit Burgberg und die besondere Tierwelt dort